写在前面 引物设计几乎是每个分子实验室的研究生必备的一项技能。目前,已经有许多成熟的引物设计软件供大家使用,如本地版的Primer5以及NCBI...
写在前面 由于我们实验室的主要研究对象是荔枝,而在ncbi上的blast中还没收录荔枝基因组信息,所以使用起来不是那么方便。那么我们能不能实现一...
写在前面 刚开始整数据库的时候,用过viroBlast搭建Blast服务,详见用viroblast搭建本地blast网站 - 简书 (jians...
写在前面 之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.weixin.qq.com/s/k...
写在前面 最近分析的物种由于国外品种与国内品种差异还是比较大,虽然大部分文章用的参考基因组都是以国外品种为主,但是由于考虑到目前我这边数据几乎全...
写在前面 硕士期间在折腾某些分析的时候,就发现好些软件的操作文档都是用GitBook写的,并且挂到网上供用户检索与浏览,实在是方便而又简洁好看 ...
写在前面 一般在进行公共测序数据挖掘的时候,需要从公共数据库中(SRA、ENA、DDBJ等)下载自己所需的测序数据。下载数据时,往往会遇到网速限...
对于非模式物种,需要做GO或KEGG富集,可以尝试使用EGGNOG-Mapper来对你的物种序列进行快速注释。在注释结果文件中,可以同时获得序列...
写在前面 最近有给网站统计访问量的需求,一开始是用 PHP+MySQL 来实现,大致思路是:用PHP获取每次登陆网站的用户数据,并存储在MySQ...