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    基因表达分析(上)- 差异表达分析

    基因表达 什么是基因表达,如下是来自于维基百科的解释: 研究方法 定量PCR 这部分我不太懂,所以就放几段百度百科和维基百科的定义。 百度百科 ...

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    如何对基因组序列进行注释

    基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de ...

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    这或许是我写的最全的BLAST教程

    Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tbl...

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    ChIP-seq基础入门

    理解ChIP-Seq 到了目前这个水平,我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 ...

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    转录组入门(7):差异表达分析

    这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。...

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    转录组入门(5): 序列比对

    欢迎来GitHub上fork,一起进步: https://github.com/xuzhougeng 比对软件很多,首先大家去收集一下,因为我们...

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    UpSetR:集合可视化神包

    对于集合的可视化,第一时间想到的都是韦恩图(venn diagram),一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加,比如...

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    纯二代测序从头组装基因组

    基因组组装 基因组组装一般分为三个层次,contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(re...

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    基因表达分析(中)- 富集分析

    回顾 首先对基因表达分析(上)做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具:RNA-Seq,microarray, qRT-PCR等(欢迎补充) ...

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