一.样本表达分布 箱式图 小提琴图 概率密度分布图 以上三个图结合起来可以看总体样本表达分布图 二.样本的相关性 层次聚类树————通过计算点与...

grep 只要出现gene字眼都查找出 精确查找，一个单词一个单词的搜索 用于找文件前缀 到file文件里面查找关键词grep -w -f fi...

TCGA workfolw RMD格式 R包安装 数据下载 文件类型介绍 manifest xml counts 本文的内容是用GDC下载并整理...

• 查看CPU信息：lscpu • 查看内存信息：free -h • 查看硬盘信息：df -h 显示当前文件夹的大小image.png 打印变量...

上一步差异表达分析拿到了表达谱【比如当用药物处理之后，实验组中哪些基因的表达发生了变化】 GO数据库 Gene Ontology 允许在各种水...

本文的内容是用GDC下载并整理表达矩阵和临床信息数据。 1.从网页选择数据，下载manifest文件 数据存放网站：https://portal...

使用两个软件对fq数据进行比对，得到比对文件sam/bam，并探索比对结果。三个常用参考基因组数据库：Ensembl：www.ensembl.o...

转录组分析总流程 数据质控 背景知识 数据量的统计方式image.png sra转换成fastq 质控 image.pngBut what do...

参考：生信技能树；百迈克生物科技；晶能生物；华大基因；千年基因 一、外显子组测序技术简介 外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DN...