240 发简信
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    conda的安装与使用 2.0版(2022-08-12更新)

    有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问...

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  • 用pheatmap画热图

    假装是前言 学了很久的R,一直也没啥进展,之前一直觉得R不是很容易的东西吗,复制粘贴代码就好了。。emmm,太年轻太年轻。。 我用R的日常就是画...

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    MCscan踩坑记录

    最近在帮忙做一个大文章,用到这个神奇的软件,做个踩坑记录。 软件是由大拿唐海宝老师写的。ps: 见过唐老师本人,高高帅帅的,说话又好听,要被迷倒...

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    「2022-01-04更新」HiC软件安装篇之Lachesis

    2022-01-04 update: 更新了一些错误集锦 Lachesis是希腊神话众神之一,负责决定生命之线的长度。但是咱们这个lachesi...

  • 国内anaconda镜像站点汇总(2022-04-17更新)

    添加镜像的命令 在国内使用 conda 镜像的时候最好删除一下~/.condarc 里的 defaults 频道。defaults 这是个官方的...

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    lachesis辅助组装流程

    准备工作: 准备数据参考基因组:Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fastaHiC数据:data_1.fastq...

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  • 用hifiasm组装基因组

    hifiasm大概是目前为止支持PacBio HiFi数据组装的所有软件中表现最优异的软件了。它不但能输出primary assembly re...

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    conda的安装与使用(2021-04-27更新)存档版

    2021-04-27 update: 更新了提供conda镜像的大学的列表2021-04-13 更新预告: 本来打算在阅读量过40万的时候更新一...

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  • RNA-seq常用命令(无参)

    0.前期准备 先在工作目录下创建以下几个目录: 1.下载SRA 先cd到01.raw_data目录下,执行以下命令(二选一): axel是一种多...

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个人介绍
PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop