卖萌哥 - 简书

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「2022-01-04更新」HiC软件安装篇之Lachesis
2022-01-04 update: 更新了一些错误集锦 Lachesis是希腊神话众神之一，负责决定生命之线的长度。但是咱们这个lachesi...

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conda的安装与使用 2.0版（2022-08-12更新）
有很多的生信软件都可以通过conda安装，省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件，conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问...

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MCscan踩坑记录
最近在帮忙做一个大文章，用到这个神奇的软件，做个踩坑记录。软件是由大拿唐海宝老师写的。ps: 见过唐老师本人，高高帅帅的，说话又好听，要被迷倒...

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【基因组】那些接收植物基因组de novo组装文章的期刊(2021-3-18更新)
2021-3-18 update: 一个新的铁皮石斛基因组发表在《药学学报》英文版上，该期刊最新的影响因子为7.0972020-11-18 up...

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用verkko组装基因组
背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T（telomere-to-telomere）级别的基因组组装的组装软件。 2022...

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用HiFiAdapterFilt去除hifi reads的接头序列
最近在处理PacBio的HiFi数据，记录一下分析的过程。背景介绍今天介绍的这个软件叫做HiFiAdapterFilt，是一个用于从PacB...

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10x基因组数据的组装
10x genomics除了有非常出名的单细胞转录组的业务线以外还有基于10x的基因组的业务。接下来就带大家走一走10x基因组数据的组装流程。 ...

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国内anaconda镜像站点汇总(2022-04-17更新)
添加镜像的命令在国内使用 conda 镜像的时候最好删除一下~/.condarc 里的 defaults 频道。defaults 这是个官方的...

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lachesis辅助组装流程
准备工作：准备数据参考基因组：Ler-1.allpaths_lg.final.assembly.fastaHiC数据：data_1.fastq...

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