省流版 前提条件: 有root权限 不涉及分区的删除增加重新分区 不需要重启或者关机 不需要到服务器面前才能操作,远程也可以完成 step 1:...
太长不看版 只需要使用BiocManager::install()就可以把CRAN、bioconductor、GitHub来源的包都安装上了。 ...
背景介绍 组学数据越来越大,数据传输已经成了一个组学合作研究中的重要限制因素。百度云盘是数据存储和传输的重要工具,bypy是一个为了解决数据操作...
要读的文章太多了。实在是没时间把所有的感兴趣的文章都精读一遍。那就借助GPT快速总结一下文章的内容。 文章标题:Sequence basis o...
我最近在用YGAP (Yeast Genome Annotation Pipeline) 做yeast基因组的注释。 YGAP生成的注释结果默认...
背景介绍 最近我需要通过FTP站点下载合作者提供的测序数据,因此研究了一下怎么快速地从FTP站点下载文件。 测试的工具主要是ftp和lftp 什...
背景介绍 这篇应该是10x genomics数据辅助基因组组装的最后一篇,tigmint也是这些软件之中效果最好的一个,属于压箱底的好工具。并且...
背景介绍 目前就我所知的能用于10x scaffolding的软件主要有这几个: scaff10x fragscaff tigmint+ARCS...
背景介绍 在得到初步的组装结果之后,如果手上有10x genomics的基因组测序数据的话,除了可以用supernova基于10x数据独立组装出...