发简信
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常用命令记录
压缩当前目录下所有文件 批量杀死进程 获得文件名 awk -F '_' 'OFS="_"{$NF="";print}' OFS是使用分割符输出分...
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Kraken2安装与数据库构建2022-01-02
Kraken2是一款快速宏基因组DNA序列进行物种注释的软件。我将其用于测序数据以及序列的物种的物种注释，检查测序数据以及序列是否有污染。con...
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线粒体序列信息提交NCBI2021-07-31NCBI主页进入提交界面 附上提交界面网址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/[https://submit.nc...
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模型选择准则:利用IQtree结果计算AIC&BIC赤池信息准则（Akaike Information Criterion，AIC）贝叶斯信息准则（Bayesian Information Cri...
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系统发育关系:系统误差
随机误差随着数据量增加而减少，系统误差随着数据量增大而增大。常见的系统误差包括三种:第一种是序列组成异质性(compositional hete...
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MEGA导出蛋白编码序列第1,2位密码子2021-01-241.准备一个密码子比对好的序列 2.使用MEGA打开选择分析模式 3.选择核酸序列 4.询问是不是编码蛋白序列，选择“是” 5.选择序列物种类群...
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Conda BUSCO4的安装以及使用_Augustus物种2020-09-16
使用conda创建独立环境进行安装 检查augutus是否可以使用，查看可以使用的物种数据库。 检查Busco是否可以使用，查看可以使用的物种数...
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Conda环境命令合集20200910
conda --help获取命令解释帮助 1.管理环境。 conda info -econda info --envsconda env li...
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Python脚本：fasta文件多序列信息统计
设计需求 统计fasta文件中多条序列信息，设计目标效果： 将结果输入到csv格式的表格中，因为csv格式表格用，分隔数据。脚本使用argpar...