240 发简信
IP属地:浙江
  • biostar第八课 Blast

    Blast Blast有好几个工具,blastn,blastp,blastx还有tblastn,tblastx blast 是干啥的 就是你有一...

  • Biostar 第七课01 模式识别

    模式识别的bash工具 grep egrep dreg 和 fuzznuc 通配符{m,n} 前面的字母出现次数在m和n之间 寻找基因组中的端粒...

  • Biostar第七课02 align到基因组

    这个是重点中的重点,虽然是最基础的,但是这个的结果将直接影响下游的多种分析,可以说是核心文件。 怎样去选择参数,这个貌似要看自己的观点,其实就是...

  • Biostar第六课 测序仪和QC

    454测序是第一个出来的二代测序,但是现在没人用了,因为数据处理太复杂,而且由于不是很普及,所以大家都没有心情去开发软件,现在的都是老版的软件了...

  • 4.1 biostar第四课 gene ontology

    Gene Ontology 解决两件事 注释,这个基因是啥 功能,这个基因干啥 定义人类基因名的权威组织HUGO,我看到这里的时候一度怀疑这个组...

  • 5 Biostar 第五课 FASTA和FASTQ格式

    Fasta 和 Fastq格式作为测序分析的基础,绝对是重中之重,所以了解这两个文件的构成和格式就非常重要 Fasta格式 以 > 为heade...

  • 3.2 bash 命令

    以下内容主要摘抄自上课课件,非本人原创 $(<filename) 可以用file里面的内容替代整个的$(...) 内容$(command) 用命...

  • 3.1 biostar lesson3 linux学习日记;java版本;awk

    又学一招,来自组织的微信群如果.bashrc 无法保存,解决方案删掉.swp删掉.bashrc.bak就OK conda 查看当前环境下,都安装...

  • 2 Biostar lesson 2 基础生物知识和计算机设置

    基础生物学知识 这部分的内容基本就是介绍了分子生物学的基本知识点,DNA,RNA以及蛋白这些个传统的中心法则上面的三个大面。然后介绍了基因组以及...