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phylophlan3使用(更新)
下载、安装 软件运行配置文件无需基因组fna或者faa文件基因组是fna，配置文件（下一步速度慢，不推荐） 基因组翻译后的faa（速度更快，推荐...
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在shell脚本中切换conda环境导读 常用的conda activate切换conda环境的方法只能在命令行中使用，放在脚本中会报错，该如何解决呢？ 一、脚本中使用conda ...
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vConTACT2病毒分类注释文章：Taxonomic assignment of uncultivated prokaryotic virus genomes is ena...
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mmseq2序列聚类
文章标题：MMseqs2 enables sensitive protein sequence searching for the analys...
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三代组装metaFlye
github: https://github.com/fenderglass/Flye[https://github.com/fendergla...
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结构方程模型(SEM)可用于微生态研究及R语言实现导读 结构方程模型（Structural Equation Modeling，SEM）是一种能基于变量之间的协方差矩阵分析多变量之间结构关系的多...
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BPGA分析细菌泛基因组导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写，16年发表的工具，17年最后一版更新，内置KEGG ...
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dRep物种集去冗余
drep可对基因组集去冗余，留下非冗余基因组集。从运行过程来看，先进行基因预测，然后用chekm做基因组质控，也因此需要安装配置checkm，去...