发简信
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安装R包devtools遇到的报错及解决
记录一下，也许能帮到一些人 今天安装devtools包时总是报错，提示gert包配置错误ERROR: configuration failed ...
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转录组全记录：从rawdata到DEG功能富集
写在前面：本文是新手学习全记录，仅供参考，欢迎交流！ 1. rawdata 1.1 QC 1.2 数据量统计 调用工具：iTools使用： 2....
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DESeq2差异分析十全大补使用笔记写在前面：新手老菜鸟，个人心得，不足之处欢迎交流指正；写作不易，转载前请联系我征得同意，谢谢。 1.基本原理 1.1 概述 全称：DESeq2 ...
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ggplot2一页多图Rmisc-multiplot功能新手排雷
哈，三月是适合写简书的月份~这只是一篇短的心得，记录自己刚刚遇到的问题，供大家参考。 背景：在用DESeq2做转录组差异基因，有几个关注的mar...
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Duplication rate：NGS测序重复率计算
写在前面：最近很纠结于测序数据的重复率，虽然是单细胞会难免有bias，但是fastqc和fastp两款软件计算出来的dup%简直差太大了，琢磨了...
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我的RNA-Seq（1）hisat和bowtie比对结果解读
转录组数据比对，选用了hisat2，比对之后发现结果不太懂，于是整理了这篇笔记与大家分享，欢迎交流。 此处是一个转录组数据hisat2比对结果，...
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MEGAN6安装及使用的问题
最近接手了一个宏基因组项目，做了一段时间，已构建群体的基因丰度集，其间遇到的种种问题暂且不表。本以为接着就可以进行结构和功能注释，忙活了半个月终...
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我的ChIP-Seq(5): peaks注释
注释一般有以下几种方法，但是一般经验有： 1.比对时下载UCSC格式的参考基因组，后续操作障碍少2.数据准备要严格按照软件的说明，若遇到格式正确...
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我的ChIP-Seq(4):MAnorm差异分析哈哈，搜了一圈没发现网上有关于MAnorm的中文教程或者是说明，本文将是第一篇~撒花✿✿ヽ(°▽°)ノ✿那就要用心写了，感到鸭梨.jpg== 首...