组学大讲堂 - 简书

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组学大讲堂/丁香园合办《GEO/TCGA 数据挖掘实操培训班》邀您参加！
羡慕别人实验室可以做测序做芯片，数据多，好发文？其实利用GEO、TCGA 等公共数据库里的海量资源，分析一下，你也能发自己的文章，虽然只有三分，...

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GEO、TCGA多数据库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关键基因
胰腺导管腺癌的五年生存率低于5%，是目前主要致死的癌症之一。如何结合多个公开数据库数据分析和挖掘此类癌症临床诊断和预后的关键基因呢？这里就给大家...

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TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析
嫌色细胞癌属于肾细胞癌的一种，约占4-5%。利用公共数据库数据筛选此类癌症的相关biomarker进行有效的临床诊断和预后也是公共数据分析的一个...

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silva做菌种鉴定
简介： SILVA一词起源于拉丁文silva（意为forest），它是一个包含三域微生物（细菌、古菌、真核）rRNA基因序列的综合数据库，其数据...

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SignalP：信号肽预测工具
SignalP是一个信号肽预测服务器，它的功能是预测给定的氨基酸序列中是否存在潜在的信号肽剪切位点及其所在，原核生物和真核生物都可以进行预测。目...

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使用官方gdc-client软件下载TCGA数据
要是有gdc-client软件下载数据，需要以下三步才能完成： 1、GDC筛选检索下载需要数据的Manifest文件 TCGA改版后，下载方式变...

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GEO数据库挖掘—WGCNA鉴定骨肉瘤转移相关基因
骨肉瘤又称为成骨肉瘤，是一种恶性骨肿瘤，多出现早期转移和高死亡率。更好的研究和探索骨肉瘤早期转移的分子机制将有利于进行癌症的治疗，刚好这里就给大...

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GEO 数据介绍及在线下载
1、什么是GEO数据库呢？ GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database，是由美国国立生物技术信息中心NCB...

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GEO数据库的搜索下载数据技巧
1、首先GEO数据库是个什么鬼呢？ GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维...

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