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  • NCBI上基因组文件格式及解释

    最近在对于一些关于基因组的数据进行处理,发现如果在NCBI上下载一个物种例如E. coil的基因组序列之后,有很多并不常见的文件类型,例如.as...

  • R从数据框中按组别移除离群值

    离群值(outlier)通常被定义为小于 QL - l.5 IQR 或者 大于 Qu + 1.5 IQR的值,QL称为下四分位数, Qu称为上四...

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    R中利用unite函数进行列合并

    1. 介绍 unite函数是tidyr包中的一个非常实用的函数,和separate函数相对应,可以对于数据框进行按照格式的列合并。 2.用法 下...

  • R中将循环产生的数据框合并

    1.问题 今天利用R写循环的时候出现了一个问题,循环内会产生多个数据框,希望将这多个数据库合并并生产一个最终的数据框,最后利用了list和do....

  • R将包含重复列的去重并合并值

    1. 问题 假设我们有数据框df如下: 所示ID915和951前面的部分都重复了,现在我们想把它变成如下 我们可以根据以下命令进行实现 2. 解...

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    酵母双杂交系统解析

    1. 简介 研究蛋白质之间的相互作用是当前蛋白质组学研究中的一个热点,常见的研究方法有以下多种: 其中酵母双杂交技术作为发现和研究在活细胞体内的...

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  • 富集分析(超几何分布)(Fisher's Exact Test)

    1. 简介 超几何分布(hypergeometric)是统计学上一种离散概率分布。它描述了由有限个物件中抽出n个物件,成功抽出指定种类的物件的个...

  • R中的S3和S4简介

    R语言有四大类型系统:基础类型、S3类型、S4类型和RC类型。 R虽然被认为是一种函数式语言,但是同样支持面向对象编程,意味着R将对象作为程序的...

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    WGCNA构建基因共表达网络详细教程

    这篇文章更多的是对于混乱的中文资源的梳理,并补充了一些没有提到的重要参数,希望大家不会踩坑。 1. 简介 1.1 背景 WGCNA(weight...