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    snpEff使用说明(下)-SnpEff注释SNP/INDEL

    上一期,给大家介绍了SnpEff注释数据库。这一期着重介绍SnpEff的命令,最后一期介绍注释结果解析 准备文件已经注释好的物种SnpEff注释...

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    snpEff使用说明(上)-了解及创建SnpEff注释数据库

    SnpEff是一款注释变异位点(SNP+InDel+MNP)和预测变异对基因的影响(例如氨基酸变化)的工具。 用法: 输入文件:输入是变异位点(...

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    R绘制火山图 EnhancedVolcano+ggplot

    什么是火山图? 火山图其实是一种很形象的叫法,它可以通过关注对象的落点从而直观地展示该对象的所属区域。其通常用于展示差异结果,比如RNA-seq...

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    pheatmap 相关性热图 基因表达量热图

    热图 热图概念:热图是一个以颜色变化来显示数据的矩阵,可以简单地聚合大量数据,并使用一种渐进的色带直观地展现空间数据的相对大小。 热图在生物学中...

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    clusterProfiler基因功能富集分析 +气泡图

    1. 非模式生物 非模式生物需要提前从AnnotationHub抓取目标物种的OrgDb数据库,这个库里包括Uniport,ENSEMBL,EN...

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