写于20201114这部分,我是进行了基因组各个组分的一些统计。详细内容如下: 01.DMR和NSR在基因组中各个组分的占比 02.基因组各个基因组成分(exon、intro...
多重序列比对是对三个以上的生物学序列所作的序列比对。利用ClustalX可以进行多重序列比对,结合GeneDoc可绘制出漂亮的多重序列比对图,满足高质量期刊的要求。 ...
1️⃣ 比对软件对fasta 序列进行比对🍒比对方法可以有MEGA(ClustalW,Muscle), ClustalX以及MAFFT等软件。还可以用GeneDoc软件自身进...
本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的,还有就是生物信息学方面的,总而言之,言而总之,希望能够帮助到大家。 关键词:生物信息学工具;绘图工具 1、itol用于对系统进化...
参考:https://www.bilibili.com/video/BV13t411372E?p=50 多序列比对,multiple alignment,是对两条以上的生物序...
导语: 前面的推文简要介绍了Jalview的大体功能,本以为对该软件的需求不会很大。但是随着这几篇推文“,”中发现的一些问题,今天有必要对Jalview这款多序列比对软件的具...
Markdown是一种纯文本格式的标记语言。通过简单的标记语法,它可以使普通文本内容具有一定的格式。 相比WYSIWYG编辑器 优点:1、因为是纯文本,所以只要支持Markd...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
最近要处理一些基因注释的文件,要用到bedtools这款经典的软件,在慢慢接触到这款软件才发现其功能的强大之处,在接下来的几个星期内将会大家一起入门并且学习掌握使用bedto...
前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的处理分析流程,根据 RNA-seq 测序技术的不同,可以分为三种: short-read long-read direct ...
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https://www.jianshu.com/p/e9cebbd8ef5...