发简信
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生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，...
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生信 | 生信人搭建数据库的学习流程
写在前面 目前各种组学培训开展的如火如荼，却鲜有生物信息学数据库搭建的相关教程和学习流程。原因有以下几个： 1.学习数据库的搭建付出多，回报少。...
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生信 | IGV Web快速搭建（无需root，无需更改配置文件）最近需要将ATAC-Seq生成的bw导入IGV查看peak的分布情况，但是一个个的将bw文件从服务器上下载到本地再传到IGV里面太麻烦了，偶然间...
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生信 | scATAC-Seq数据获取（超快sra转fq）部分代码参考自10x genomics官网[what-is-cell-ranger-atac]，但绝大多数代码融入了我自己的思考 1、上游分析（...
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生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到...
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生信 | Circos实战写在前面 由于circos官网的教程太全面了，虽然好但反而感觉比较复杂，难易上手，因此我将他们精简了一下。由于官网的教程中包含的数据太杂了，所以...
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生信 | Circos的安装写在前面的碎碎念 最近在尝试Cricos这款优秀的可视化软件，但是在安装的时候有一些问题，记录一下。首先我是conda的忠实用户，因此下载软件的...
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秘籍 | GitHub打不开？一招搞定！正常网址打不开？太慢？： https://github.com/PacificBiosciences/falcon/blob/HEAD/make...
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秘籍 | 计算基因组的有效大小（effective genome size）
写在前面 最近在ATAC-Seq中call peaks的时候发现需要用到基因组的有效大小（effective genome size） 方法一 ...