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  • UCSC ENSEMBL NCBI基因组各个版本对应关系 下载地址

    一、对应关系 NCBI的版本包括GRCh36,37,38,UCSC包括hg18,19,38, ENSEMBL有各种release,他们之间的对应...

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    单细胞测序R包PAGODA使用

    pagoda是2016年在nature methods发表的一个分析单细胞测序的方法,这个包并不是很红火,只是最近在学习另一个基于RNA速率推断...

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  • R中连接

    在R语言中 paste 是一个很有用的字符串处理函数,可以连接不同类型的变量及常量。 函数paste的一般使用格式为: paste(..., s...

  • RNA-seq分析:从fastq到差异表达基因

    RNA-seq的数据分析是比较简单基础的分析,大概流程就是处理下机的fastq数据(trimmomatic),比对到人类基因组(hisat2)然...

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    maftools使用

    maftools是对WGS和WES数据进行上游分析之后,进行somatic mutation分析的一个非常好用的包,用非常简短的几行代码即可出图...

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