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    基因组数据的重测序分析

    我通过查资料获得已知达松维尔拟诺卡氏菌亚种(cardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei)的基因组原始...

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    测序数据比对和变异检测

    全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。所以首先我们需要某个物种的全基因组序列和...

  • 基因组重测序数据分析脚本

    生成的文件说明: 1.~/Process/fastqc_result 用于存放质量评估的结果2.~/Process/trim_out 用于存放过...

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    fastqc 批处理文件

    当我们获取到许多的测序数据的fastq文件,我们为了方便,通过shell编程写一个批处理脚本来对许多文件进行质控。1 首先在创建一个文件夹存放...

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    基因组的重头组装

    1. de novo assembly De Bruijn 图是目前二代测序序列最常用的拼接算法,该算法将已经非常短的reads再分割成更多个k...

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    trna二级结构预测

    ​ trna二级结构的预测可使用RNA Structure的预测服务器 http://rna.urmc.rochester.edu/RNAs...

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    测序数据的获取、格式转换和质控

    1. 获取测序数据 Aspera 软件以最快速度传输全球数据,不受文件大小、传输距离或网络条件的影响。 ubuntu下安装Aspera软件 下载...

  • 简介不同的文件格之Fasta格式

    在浏览核酸蛋白质数据库的时候会经常遇见不同的文件格式,常见的有Fasta格式文件、NBRF/PIR格式文件、 EMBL/SWISSPROT格式文...

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    散点图的绘制

    1.R提供的数据集:Puromycin Puromycin数据集含有23行3列的数据。 截取符合条件的子集 画以conc为x轴,rate为y的散...