Conda 安装不同的R环境

conda create -n R3.5 
conda search R
#注意修改CONDA本地镜像地址,否则有时候会出现错误。
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    conda config --set show_channel_urls yes
#注意要把.condarc文件里面的--default 选项删除否则有时候出错:CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://repo.anaconda.co
#Ubuntu下
vim .condarc #用户根目录下修改

Windows下首先需要找到.condarc文件
如果你不知道在哪的话可以这样
win+R
输入%HOMEPATH%


在这里插入图片描述

然后找到.condarc文件

把里面的内容替换成下面的

channels:
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
show_channel_urls: true
ssl_verify: false

conda下安装R

conda search R
conda install r=3.5.1

修改国内镜像(非必须)

options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))
#安装开发环境依赖
sudo apt install build-essential libcurl4-gnutls-dev libxml2-dev libssl-dev

#可以安装R包了
install.packages("devtools")

国内其他镜像
China
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ TUNA Team, Tsinghua University
http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ TUNA Team, Tsinghua University
https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ University of Science and Technology of China
http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/ University of Science and Technology of China
https://mirror-hk.koddos.net/CRAN/ KoDDoS in Hong Kong
https://mirrors.eliteu.cn/CRAN/ Elite Education
https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/ Lanzhou University Open Source Society
http://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/ Lanzhou University Open Source Society
https://mirrors.tongji.edu.cn/CRAN/ Tongji University
https://mirrors.shu.edu.cn/CRAN/ Shanghai University

R-安装、卸载、查看及卸除加载包

1. 安装包

install.packages("BiocInstaller")

2. 卸载已安装包

remove.packages("BiocInstaller")

3. 查看已加载包

(.packages())

4. 卸除已加载包

detach("package:BiocInstaller")

5. 查看已安装的包

installed.packages()

6. 查看某个安装包提供的函数

help(package="BiocInstaller")

7. 查看某个函数属于哪个包

help("biocLite")

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