「r<-碎碎念」UCSCXenaTools 可以引用了

UCSCXenaTools <https://github.com/ropensci/UCSCXenaTools> 是去年10月份左右开始开发的,是我写的第一个R包,目的是有效地选择和下载UCSC Xena提供的公开数据集,有利于分析的流程化和可重复性。最近该包通过了 rOpenSci项目的审核,并极快地发表在了 JOSS 上。

JOSS 关注软件文档而不是文章内容,这一点我很喜欢,如果有朋友开发了一些工具不妨考虑下。

CRAN Badge 显示 10 个月以来该包有近 8000 次的下载量,虽然完全不能同流行包相比,但编写出来的东西能够有一些用户在使用,偶尔还有一些邮件反馈,这让我觉得比较荣幸和开心。

我知道使用该包的人大多数都是癌症科学研究者,所以请大家在发表paper的同时引用一下本包,这是最好的鼓励😁:

Wang et al., (2019). The UCSCXenaTools R package: a toolkit for accessing genomics data from UCSC 
 Xena platform, from cancer multi-omics to single-cell RNA-seq.
 Journal of Open Source Software, 4(40), 1627, https://doi.org/10.21105/joss.01627

@article{Wang2019UCSCXenaTools,
    journal = {Journal of Open Source Software},
    doi = {10.21105/joss.01627},
    issn = {2475-9066},
    number = {40},
    publisher = {The Open Journal},
    title = {The UCSCXenaTools R package: a toolkit for accessing genomics data from UCSC Xena platform, from cancer multi-omics to single-cell RNA-seq},
    url = {http://dx.doi.org/10.21105/joss.01627},
    volume = {4},
    author = {Wang, Shixiang and Liu, Xuesong},
    pages = {1627},
    date = {2019-08-05},
    year = {2019},
    month = {8},
    day = {5},
}

最后祝大家七夕节快乐。

春风十里,不如有你~

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