腹泻
近年来仔猪流行性腹泻呈现出新的变化，以往猪场在爆发流行性腹泻以后，通常有很长时间的保护，不容易复发；然而如今，爆发过流行性腹泻的猪场，经常会反复发生，甚至一年重复发生2-4次，这些反复发生流行性腹泻的农场通常都有以下共同特点：
第一、蓝耳病不稳定；
第二、猪场蓝耳病毒毒株较多；
第三、使用过强毒株的蓝耳活疫苗；
第四、每年蓝耳疫苗普免次数较多；
第五、返饲效果一般。
总结这些特点可以发现，蓝耳病毒不稳定，流行毒株多，并且使用强毒株蓝耳苗进行频繁免疫，这些都可能导致母猪免疫抑制，免疫反应较差，导致母猪奶水中的母源抗体含量有高有低，母源抗体低的仔猪保护力较差，当接触到环境中的PED野毒时，就会发生腹泻。
补充参考：2011-2012年对广西11地市多家猪场共232份仔猪腹泻临床样本的流行病学调查发现，猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪轮状病毒（PoRV）的阳性率分别为37.50%和0.03%，猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）为阴性。提示2011年至今致使广西仔猪腹泻的病毒主要是PEDV。
大部分广西流行毒株与2011年以来我国广东、福建、江苏、江西四省流行毒株的亲缘关系较近，与2007年以来泰国、韩国的流行毒株亲缘关系也非常密切，但与我国2006年前分离获得的北方毒株、经典疫苗株、韩国疫苗株亲缘关系较远。
伪狂犬
通常来讲，伪狂犬病在疫苗和诊断手段的配合下，是可以得到有效控制的，欧美许多国家多年前就已经净化了该病。并且多年来对中国农场的拜访发现，伪狂犬国产苗或者进口苗效果都还不错，所以伪狂犬病不应该成为一个主要问题。对于中国北方的伪狂犬病毒是否出现变异，目前尚未看到相关报道，所以也不能轻易下结论，需要咨询相关省份的科研机构。对于伪狂犬病的控制，要特别注意猪群的流动管理，坚决杜绝将种猪育肥猪与商品育肥猪混合饲养。一旦混养，会造成商品育肥猪将伪狂犬病毒传染给种猪育肥猪（后备猪），当后备猪与种猪群并群后，就可能造成伪狂犬病毒在种猪群的广泛传播。值得注意的是，种猪一旦感染该病毒，会终生带毒。
补充参考：2011年华农分离出的8株最新流行伪狂犬野毒，经测序发现，其中部分流行野毒与经典伪狂犬病毒在TK、gB、gC、gE等基因位点上发生了多个碱基的突变和缺失，这些突变缺失可能会导致流行性毒株毒力或抗原性的改变，但需要进一步研究。
口蹄疫
口蹄疫是一种外来性疾病，只有在农场生物安全没有做好的情况下才会传入。口蹄疫的发生也是一个指示剂，它提示猪场自身的生物安全防控出现疏漏，如果口蹄疫能够传入猪场，那么其他传染病也有可能传入。所以要加强农场的生物安全，规范猪场的人员操作，并做好疫苗免疫，建议种猪跟胎打疫苗，育肥猪最少打两次疫苗。打完疫苗，做好生物安全措施，并且不传入新的口蹄疫病毒，一般不会发病；如果还是发病，说明病毒可能发生变异，这就需要政府部门去检查、分离新的流行毒株，验证是否可以通过现有的疫苗去控制，并判断是否需要研制新的疫苗。
蓝耳病
中国现在很多猪场都受到高致病性蓝耳病毒的影响，该病毒一旦进入猪场，就很难再清除掉。目前国内很多大型场都拥有自己的核心种猪群，他们开始考虑将曾祖代、祖代种猪蓝耳病毒控制为阴性。
绝不能依靠频繁的疫苗免疫来控制核心种猪群的蓝耳病，因为蓝耳病毒本身具有免疫逃避作用，并且极易变异，频繁免疫会促使病毒发生变异，导致免疫失败；并且目前蓝耳病疫苗本身也并不完美，存在交叉保护能力差等问题。
首先我们要知道，蓝耳病毒有欧洲株、美洲株、高致病性毒株三大类，并且每一类又有很多亚群，在中国现在广泛使用活疫苗的前提下，在同一头猪体内极有可能分离到好几种蓝耳病毒，并且各病毒间的同源性会存在一定的差别。所以当我们选择一种疫苗去控制猪群的蓝耳病时，并不能对猪体内的每一种蓝耳病毒都产生有效保护。当我们控制住一种蓝耳病毒，第2种、第3种蓝耳病毒由于与所免疫疫苗同源性低，难以有效保护，从而造成一年爆发好几次蓝耳病的情况。这几次蓝耳病的爆发很有可能是由于不同的蓝耳病毒毒株所引起。
总结多年的临床与科研经验，对于蓝耳病的控制，必须要做到以下几点：
第一、 防止病毒血症，以及由此产生的垂直传播；
第二、 降低带毒猪水平传播病毒；
第三、 防止蓝耳病毒的变异；
第四、 检讨农场猪的流动是否合理；
此外，目前美国最新的研究发现，猪第四对染色体及X染色体上面存在某种遗传基因，该基因决定猪对蓝耳病毒的天然抵抗能力。这就意味着，美国已经开始研究对蓝耳病具有天然抵抗能力的猪，也提示我们农场应该主动淘汰蓝耳病毒敏感猪。
补充参考：美国农业部对6个种猪场2600头试验猪进行蓝耳病毒攻毒试验结果表明，猪群可分为三种类型猪：蓝耳病毒敏感猪（高病毒载量/低体重增长量）、蓝耳病毒抵抗猪（低病毒载量/高体重增长量）及蓝耳病毒耐受猪（高病毒载量/高体重增长量）。这为亚群母猪的存在提供的最好的证据，说明部分猪群可能具有蓝耳病毒耐受性；也就是说即使在病毒载量相对较高的情况下，这部分猪也能保持正常生长。
圆环
圆环病毒与猪的多种疾病相关，如PMWS，PDNS以及PRDC等。但实践证明，只要坚持使用疫苗，控制圆环病毒也并非难事。要坚持对核心群种猪进行疫苗免疫，特别是公猪，除了定期免疫疫苗以外，还要注意公猪的日常管理。不能将公猪站的公猪拉出来查情诱情，更不能将不发情的母猪拉到公猪站诱情，因为圆环病毒是可以通过精液进行传播的。
补充参考：在泰国若农场猪群从未使用过圆环疫苗，第一次注射圆环疫苗时必须对所有怀孕母猪，后备猪，公猪普免两次，时间相隔3周，然后再对怀孕母猪跟胎注射圆环疫苗，在母猪分娩前5周或者怀孕11周注射1针圆环疫苗，以增加母猪的母源抗体。保证母猪正常采食及泌乳，仔猪按时吃到新鲜初乳，可获得足够母源抗体。建议在21日龄对仔猪免疫圆环疫苗，仔猪圆环苗免疫时间不宜过早，过早免疫会导致母源抗体的中和（研究证实圆环死苗也可以中和母源抗体）；另外建议使用水佐剂灭活苗，尽量避免使用油佐剂苗。
