【r<-包】管理你的R包——pacman包介绍

Tyler W. Rinker & Dason Kurkiewicz

翻译:诗翔

pacman包是一个整合了基础包library相关函数的包,用于更方便地对R包进行管理。该包可以添加到.Rprofile以便于显式地指定该包的函数,增加工作效率。其中关键函数p_load可以很好地提升论坛提问与博文,它会自动加载包,如果没有找到,会自动安装缺失包。

pacman包中的函数都以p_xxx的格式存在,其中xxx是函数执行的功能。比如p_load允许用户载入一个或多个包,用于替换libraryrequire函数,如果包不在本地存在,它会自动为你安装。对于大多数的pacman函数,参数不需要指定为字符串。

安装、载入、卸载、更新与删除

速查表

Pacman 函数 Base 等价 描述
p_load install.packages + library 载入与安装包
p_install install.packages 从CRAN安装包
p_load_gh NONE 载入和安装Github包
p_install_gh NONE 从Github安装包
p_install_version install.packages & packageVersion 安装包的最小版本
p_temp NONE 暂时安装包
p_unload detach 从搜索路径卸下包
p_update update.packages 更新过期包

The heart of pacman is it's ability to reduce typing in package management actions. The functions in this section act on packages.

安装和载入

p_load 是通常使用的工具,可以安装、加载和更新包。函数形式如下

p_load(..., char, install = TRUE, update = getOption("pac_update"), character.only = FALSE)

...参数传入包名,比如你需要用下面的方式安装一系列包:

packs <- c("XML", "devtools", "RCurl", "fakePackage", "SPSSemulate")
success <- suppressWarnings(sapply(packs, require, character.only = TRUE))
install.packages(names(success)[!success])
sapply(names(success)[!success], require, character.only = TRUE)

使用pacman可以简化为:

pacman::p_load(XML, devtools, RCurl, fakePackage, SPSSemulate)

仅安装

有些用户想仅仅安装包,这可以使用p_install(别名为p_get)。

p_install(dbConnect, qdap, reports)

从Github安装和载入包

pacman提供了从Github上安装和载入包的函数,其实就是基于devtools包的函数:

Note: Packages are passed as character vector repository addresses in the form of username/repo[/subdir][@ref|#pull].

p_install_gh(c("Dasonk/githubSearch", "trinker/regexr", "hadley/httr@v0.4"))
p_load_gh("Dasonk/githubSearch", "trinker/regexr", "hadley/httr@v0.4")

安装包最小版本

有时候需要安装特定版本的包,可以使用:

p_install_version(
    c("pacman", "testthat"),
    c("0.2.0", "0.9.1")
)
Version of pacman (v. 0.2.0) is suitable

Version of testthat (v. 0.9.1) is suitable

暂时安装

p_temp允许用户暂时安装一个包,线程一关闭即消失:

p_temp(aprof)

p_isinstalled(aprof)
p_isloaded(aprof)
> p_temp(aprof)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.1/aprof_0.2.zip'
Content type 'application/zip' length 34037 bytes (33 Kb)
opened URL
downloaded 33 Kb

package 'aprof' successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded binary packages are in
        C:\Users\you\AppData\Local\Temp\RtmpYh6bSr\downloaded_packages

aprof installed
Loading required package: aprof
> 
> p_isinstalled(aprof)
[1] FALSE
> p_isloaded(aprof)
aprof 
 TRUE 

卸载

另一个好用的函数是可以将某个包从当前路径卸载(不是删除),但基本的R包不能被卸载(R启动就用到的包)。

格式如下:

p_unload(..., negate = FALSE, char, character.only = FALSE)

例子:

p_load(lattice)
p_isloaded(lattice)
p_unload(lattice)
p_isloaded(lattice)
> p_load(lattice)
> p_isloaded(lattice)
lattice 
   TRUE 
> p_unload(lattice)
The following packages have been unloaded:
lattice

> p_isloaded(lattice)
lattice 
  FALSE 

更新:

p_update() 

有时候想只查询,不实际更新:

p_update(FALSE) 

删除:

p_delete(fakePackage, stats)
> p_delete(fakePackage, stats)
The following packages are a base install and will not be deleted:
stats

The following packages not found in library:
fakePackage

线程信息

速查表

Pacman Function Base Equivalent 描述
p_loaded .packages & sessionInfo 列出已加载包
p_isloaded NONE 测试某包是否加载

用法:

p_loaded()

返回除了基础包的其他包,下面可以返回所有包:

p_loaded(all = TRUE)

检查包:

p_loaded(base, MASS)
 base  MASS 
 TRUE FALSE 
p_isloaded(methods, stats)
methods   stats 
   TRUE    TRUE 

本地包信息

速查表

Pacman Function Base Equivalent 描述
p_author packageDescription Author of Package
p_citation citation Citation for Package
p_data data List Package Data Sets
p_depends & p_depends_reverse package_dependencies & dependsOnPkgs 包依赖或反向依赖
p_exists available.packages & list.files + .libPaths 检查包是否存在于本地或者是CRAN
p_functions loadNamespace + getNamespaceExports 包函数
p_help help HTML/PDF Manuals查看
p_information packageDescription 包信息
p_interactive NONE 交互式搜索包
p_news news 包NEWS
p_version packageVersion & R.Version 包版本
p_vignette browseVignettes 包 Vignettes查看

内容有点多,想全部学习的,查看 http://trinker.github.io/pacman/vignettes/Introduction_to_pacman.html

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