季胺盐和氯己定这两种消毒剂，不仅是环境中常用的消毒剂，更是我们皮肤黏膜消毒中常用的消毒剂。作为消毒剂，两者有很大的相似之处，比如同样作为阳离子表面活性剂，在杀菌原理有很大的相似之处，也就是PD过程很相似，另一方面，作为消毒剂有很多共同的优缺点——低毒，安全性高，但效力不强。
（一）季胺盐
临床上外科冲洗常用的消毒液之一——苯扎氯铵就是季铵盐的典型代表。
（二）氯己定
临床中，用的比较多的是醋酸氯己定或者葡萄糖酸氯己定。
从结构式可以看出，季胺盐可完全电离，因此一端具有亲水性；另一端有很长的碳链和苯环，因此具有亲脂性。而氯己定本身不可以电离，与醋酸或者葡萄糖酸反应生成了醋酸氯己定和葡萄糖酸氯己定，增加了水溶性也可电离。完全电离的一端带正电，可与革兰氏阳性菌细胞壁上的壁磷酸结合，也可与革兰氏阴性菌细胞壁上的脂多糖结合，另一端亲脂端可与胞膜内的磷脂结合，这样两端的结合就造成膜的通透性破坏，胞质外流，细菌死亡。杀菌机制跟多粘菌素很相似，一端亲水端与蛋白结合，另一端与磷脂结合从而造成膜的通透性破坏。由于革兰氏阳性菌细胞壁上的壁磷酸属于强电离，革兰氏阴性菌细胞壁上的脂多糖属于弱电离，所以这就是季胺盐类和氯己定对于革兰氏阳性菌的杀灭效果要强于革兰氏阴性菌的原因。
那对于新冠这些亲脂病毒有无杀灭作用呢？按照微生物对于外界因子的抗力排行来说，可以杀灭细菌就可以杀灭亲脂病毒，因为细菌对于外界的抵抗力要强于亲脂类的病毒。但实际上，不管是季胺盐还是氯己定都不能杀灭亲脂类的病毒。从杀菌原理来看，亲水端与包膜蛋白C端结合，另一端与磷脂结合，影响到包膜的通透性，但包膜蛋白和核衣壳的结构却未受影响，因此不能杀灭包膜病毒。
在这种背景下，就诞生了双链的季胺盐消毒剂，疏水基团的增加，不仅增加了脂溶性、增加了穿透膜的能力，也增加了其破坏蛋白内氢键的能力，所以双链季胺盐类不仅可以杀灭细菌，也可以杀灭亲脂类的病毒。
另一方面，从安全性来讲，这两类都是表面活性剂具有亲水性也有亲脂性，按照脂水分配系数来说可以透过生物膜，但它们是离子状态，由于离子障现象的存在，会被限制在膜外。两种力量的对决决定了膜内外浓度差别。低浓度~可能膜外多，高浓度~渗透到膜内多。（该段纯属个人理解）
所以两者对于黏膜细胞的损害比其他类的消毒剂小的多，安全性更好。
