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[圣诞]快速入门一个新的科研领域-文献(信息)检索与下载终极总结

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Yaocoo
2017.12.24 09:21* 字数 2753

关键词:信息检索, Open-SCI

探索一个新的领域或方向几乎是每个研究生 不可避免 且 痛心疾首 的问题。了解一个方向,自然需要阅读该方向的高质量文献(Review为主),学习相关背景和概念。此外,关注该方向最有影响力的学者和他们的研究动向往往还会有意想不到收获。本文就专门谈谈获取这些信息的一些检索工具和技巧。

目录

  1. 搜索文献
    1.1 使用通用搜索引擎搜索文献
    1.2 搜索发表在顶级期刊(如CNS)上的文献
    1.3 搜索最新(预发表)研究成果
  2. 免费下载文献
  3. 搜索并关注其他学者
  4. 搜索某一领域顶尖学者
  5. 其他常用搜索

0. 废话

之所以写这篇文章,是我最近也在不断学习新的东西,接触到很多非常非常好用的检索工具。于是乎,收藏夹里的网页一个接一个不断增加,问题也随之而来。比如,我要根据关键词“phase locking value”检索相关文献,需要将这些工具一个个打开,一个个键入关键词进行搜索,十分繁琐,甚至,还会经常用了这个忘记那个(老年痴呆重度患者)。

正所谓久病成医,为了给自己的收藏夹和大脑减负,我写了一个网页版工具 Open-SCI:http://open-sci.co.uk/,将各类检索系统集成在一起。同时,配上这篇文章作为参考,希望能够分享给更多有需要的朋友。本文会随工具不断更新。如,添加(或删除)功能,调整文章结构,逻辑,叙述条理等等。

1. 搜索文献

这一章我会使用不同类型的文献搜索工具查找“brain network”相关的文献,通过示例的方法展示它们的意义和用法。

所有演示统一以Open-SCI做示范,读者也可以去每个工具的官网尝试原版工具。

1.1 使用通用搜索引擎搜索文献

用于检索文献的工具很多,最常用的有 Google scholar, Semantic scholar 以及 Pubmed等,且可以免费使用。而其他如非常著名的 Web of Science 等,功能强大但是需要购买。鉴于我认为前者已经够用,所以对后者暂不做介绍。

这里以 Semantic scholar 为例,打开 Open-SCI ,按下图所示在搜索框中输入关键词“brain network”,并在选项列表中选择“Semantic shcolar”,单击搜索按钮或敲回车键即可搜索。

下图为搜索结果。Semantic scholar 是我最近非常喜欢的一个文献搜索工具,它为每篇文献提供“高影响力引用”和“年平均引用量”两个指数,供用户判断文献价值。而右边的“Results by year”图表还可以帮助我们看出该方向的研究热度趋势。此外,Semantic scholar 还会根据搜索内容推荐相关的研究话题和WIKI链接,非常推荐读者亲自尝试体验一番。

1.2 搜索发表在顶级期刊(如CNS)上的文献

除了使用通用检索工具搜索,我还会特别关注一下发表三大期刊 Nautre, Science, Cell (统称CNS) 上的文章。能发表在CNS上的文章,水平必然不会低,同时还能了解什么样的研究更受顶尖期刊的青睐。它们的官网也都有各自的检索系统,方便实用。

这里就让我们看看有Nature上有那些关于“brain network”的文章。

Open-SCI的所有搜索结果都会在新标签页中打开,所以刚才我们用于搜索的网页依然保留在浏览器中。此时我们只要切回搜索页面,在选项列表中选择nature,敲击回车即可,非常便捷。

需要注意的是,搜索结果中包含了nature出版社旗下所有期刊的文章,如果只想看nature正刊的文章,还要在页面中点击“Journal”,在下拉列表里选择“Nature”。如下图。

1.3 搜索最新(预发表)研究成果

通过上面的步骤,我们可以找到许多“brain network”方向非常棒的文章。但是这些都是已经发表,甚至是十几二十年前的文章。在看过这些文章对该领域有了初步了解后,我们可能还希望找一找当前最新的研究成果。

arXiv 和 bioRXiv 两个网站正好满足我们的需求。arXiv 是一个收集物理学、数学、计算机科学与生物学论文预印本的网站。许多研究工作者会将他们已完成但还未正式发表的工作挂在这里,一来方便同行评议,二来可以声明研究原创性。bioRXiv 与 arXiv 相似,但主要面向生物相关领域。

Open-SCI 同样支持 airXiv 和 bioRXiv 的搜索,使用方法同上,在选项列表中选择 airXiv 或 bioRXiv 后搜索即可。需要注意,预印本的文章没有经过同行评议,所以质量层次不齐,需要自行判断。

2. 免费下载文献

关键词:SCI-HUB, Research Gate, Google PDF

相比于搜索文献,可能很多人不是很熟悉如何免费下载文献。Sematic scholar和Pubmed都提供了部分文献的免费下载。对于它们都下载不了的文献,也可以试试在google中搜索“文章标题 filetype:pdf”,google会搜索出网上所有相关的pdf文件,很大概率包含了我们想要的文献。

当然,我这里要说的下载文献不仅仅是如此,而是要推荐两个神器中的神器,Research Gate 和 Sci-Hub。

以我们刚才检索到的这篇“The economy of brain network organization”为例,Semantic scholar没有这篇文献的全文pdf。我们点击搜索结果页面中的“view on nature”,打开这篇文献最原始的下载页面(其发表的期刊网站),页面中提示我们需要购买。不必着急,我们在浏览器地址栏中复制网页地址。然后回到Open-SCI搜索界面,在导航选项卡中选择“Sci-Hub”,将地址粘贴进搜索框,点击搜索。Sci-Hub变魔术般的为我们获取了该文献的pdf文件!嗯,向英雄致敬。

除了网址,还可以通过该文献的PMID和DOI获取全文。不过Sci-Hub最近官司吃紧,很多服务器被封杀不稳定,所以我在搜索框下方列出了多个Sci-Hub的服务器源,如果一个挂了,可以尝试其他服务器。

至于其他的方法如google搜索pdf和使用research gate都很简单,这里不做示范,欢迎自行尝试。

3. 搜索并关注其他学者

关键词: Google Scholar, Research Gate, ORCID

在阅读文献或是平时的科研工作中,我们可能会遇到一些感兴趣的学者,想要了解他们的信息或是follow他们的工作。那么如何搜索这些学者呢?

当然了,直接google他们的名字最直接简单实用。。。这里我介绍一点稍微有征对性一些的方法。一般来讲,每个学者都会有Google scholar, Research Gate和ORCID其中的一个或多个主页,所以我们可以直接搜索这些主页,这些主页中一般会有“Follow”的选项。

在Open-SCI选项卡中选择“Researcher”,输入学者姓名(这里以我自己为例),并选中相应的主页类型进行搜索。

4. 搜索某一领域顶尖学者

关键词: Google Scholar

我个人觉得这个功能更实用些。进入一个新领域时,我会想知道这个领域有哪些厉害的学者,看看他们都在做些什么。

两种方式可以搜索顶尖学者,第一种是首先搜索该领域的顶尖文章,再去搜索这些文章的作者(如前文所述)。

第二种是利用google scholar,更加快捷一些。在google scholar中搜索“label:关键词”,就可以搜到所有标有该关键词标签的学者,且按照应用量排序。同样我们用Open-SCI作演示。

示例描述:搜索做“信息论”研究的顶尖学者

在Open-SCI页面当行选项卡中选择“Researcher”,输入关键词“information theory”,并在下方选项列表里选择 subject area(推荐)或 google scholar,单击搜索。

上图是选择subject area搜索的结果,Shannon老爷子毫无悬念的排在第一位。

注:Google scholar网站中同样的搜索应输入“label:information_theory”。使用Open-SCI直接输入“information theory”即可。

5. 其他常用搜索

关键词: Quora, Research Gate, Geen Medical

这一章呢主要对应Open-SCI的“General”选项卡。这里集成了Google,Bing这些常用的搜索引擎,WIKI百科全书,以及这里我想重点推荐的Quora和Research Gate Question

读文献固然实用,但很多文献晦涩难懂,这时我们就希望能求助于别人(提问)。Quora和Research Gate Question就是提供了这样一个平台,我们可以在这里问问题,也可以直接搜索别人问过的相关问题,直接找我们想要的答案。

如下图是Quora上关于信息论的问题。

此外,最近新兴起的Geen Medical可以免费搜索、下载文献,查看期刊影响因子,也值得推荐。

结语

所有工具都已集成在Open-SCI中,使用也比较简单,因此没有一一介绍。如有信息检索相关建议意见,欢迎交流,欢迎交流,非常欢迎交流。

科研
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