R语言之可视化①⑦调色板

目录

R语言之可视化①误差棒

R语言之可视化②点图

R语言之可视化③点图续

R语言之可视化④点韦恩图upsetR

R语言之可视化⑤R图形系统

R语言之可视化⑥R图形系统续

R语言之可视化⑦easyGgplot2散点图

R语言之可视化⑧easyGgplot2散点图续

R语言之可视化⑨火山图

R语言之可视化⑩坐标系统

R语言之可视化①①热图绘制heatmap

R语言之可视化①②热图绘制2

R语言之可视化①③散点图+拟合曲线

R语言之可视化①④一页多图(1)

R语言之可视化①⑤ROC曲线

R语言之可视化①⑥一页多图(2)

R语言之可视化①⑦调色板

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正文

install.packages("RColorBrewer")
library(RColorBrewer)
display.brewer.all()
  • 连续型调色板(第一个颜色列表),适用于从低到高(梯度)的有序数据。 调色板名称是:Blues,BuGn,BuPu,GnBu,Greens,Grays,Oranges,OrRd,PuBu,PuBuGn,PuRd,Purples,RdPu,Reds,YlGn,YlGnBu YlOrBr,YlOrRd。

  • 定性调色板(第二种颜色列表),最适合表示名义或分类数据。 它们并不意味着群体之间的巨大差异。 调色板名称为:Accent,Dark2,Paired,Pastel1,Pastel2,Set1,Set2,Set3。

  • 差异调色板(第三种颜色列表),强调数据范围两端颜色相反。 分散的调色板是:BrBG,PiYG,PRGn,PuOr,RdBu,RdGy,RdYlBu,RdYlGn,Spectral

这个包甚至可以提动专门为色盲提供的颜色表

  • 仅显示色盲友好的调色板
    要仅显示色盲友好的brewer调色板,请指定colorblindFriendly选项= TRUE,如下所示:
display.brewer.all(colorblindFriendly = TRUE)
# 1. Visualize a single RColorBrewer palette 
# by specifying its name
display.brewer.pal(n, name)

# 2. Return the hexadecimal color code of the palette
brewer.pal(n, name)

函数参数的描述:
n:调色板中不同颜色的数量,最小值为3,最大值取决于调色板。
name:上面列表中的调色板名称。 例如name = RdBu。
以下R代码演示了如何显示一个单一的r颜色brewer调色板。

# View a single RColorBrewer palette by specifying its name
display.brewer.pal(n = 8, name = 'Dark2')
# Hexadecimal color specification 
brewer.pal(n = 8, name = "Dark2")

[1] "#1B9E77" "#D95F02" "#7570B3" "#E7298A" "#66A61E" "#E6AB02" "#A6761D"## [8] "#666666"

  • 在ggplot2中使用RColorBrewer调色板
    创建一个由组着色的基本ggplot,使用iris演示数据集创建基本ggplots。 我们将创建两组不同颜色的图:散点图和箱形图。

library("ggplot2")
# Box plot: changing the fill color by Species
bp <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  theme_minimal() +
  theme(legend.position = "top")
bp

# Scatter plot: changing points color by Species
sp <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Sepal.Width)) + 
  geom_point(aes(color = Species)) +
  theme_minimal()+
  theme(legend.position = "top")
sp
  • 使用r color brewer palettes更改ggplot组颜色

ggplot2中提供了两种色标功能,用于使用rcolorbrewer调色板:
scale_fill_brewer()用于箱形图,条形图,小提琴图,点图等
scale_color_brewer()用于行和点

# Box plot
bp + scale_fill_brewer(palette = "Dark2")

# Scatter plot
sp + scale_color_brewer(palette = "Dark2")
image.png

在基础图中使用RColorBrewer调色板,brewer.pal()函数用于生成颜色矢量。

# Barplot using RColorBrewer
barplot(c(2,5,7), col = brewer.pal(n = 3, name = "RdBu"))

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