基因组学系列专栏

基因组学与人类健康

大家好!我是Honglei,欢迎大家来到基因组学系列专栏!

从本篇开始,我将分成17篇文章为大家介绍关于基因组学的以下方面内容:

  1. 基因组学简介(Introduction to Genomics)
  2. 测序技术 (Sequencing techniques )
  3. 序列组装 (Genome Assembly)
  4. 基因组注释 (Genome annotation)
  5. 宏基因组学 (Metagenomics)
  6. 宏基因组数据分析实战
  7. 群体遗传学 (Population genetics)
  8. 原核和真核生物的基因组结构 (Genome structure)
  9. 功能基因组 (Functional genomics)
    • 转录组 (Transcriptomics)
    • 蛋白质和DNA作用与开放染色体 (Protein-DNA interactions and open chromatin)
    • 表观基因组学 (Epigenomics)
  10. 转录组 (RNA-Seq) 数据分析实战
  11. 单细胞基因组学 (Single-cell genomics )
  12. 个人基因组和精准医学 (Personal genomics and precise medicine)
  13. 计算基因组学 (Computational genomics)
  14. 整合基因组学,多组学分析 (Integrative analysis, multi-omics analysis)
  15. 基因调控网络 (Gene regulatory networks )
  16. 癌症基因组学 (Cancer genomics)
  17. 比较基因组学 (Comparative genomics )

本系列的内容主要来自我在UC IRVINE(加州大学尔湾分校)的基因组学原理(Principle of Genomics)的课程笔记和一些网络资源(会做出引用)。

这门课由Ali MortazaviKatrine Whiteson教授讲解。两位教授中,Ali从事测序技术和基因组研究,参与过ENCODE千人基因组(1000 Genome)等计划,Katrine则专注于微生物组学(Microbiome)研究。

由于作者是计算机背景,生物知识水平有限,如有错误,还望各位大神指出,也欢迎大家留言交流 :)