内存计算

by 清华大学

为什么并行计算?

  • 计算量大
    • 单进程算得不够快,多CPU算
  • 内存需求大
    • 单机内存不够大
    • 内存随机访问比硬盘随机访问快100,000倍
  • I/O 量大
    • 单个硬盘读写太慢,多个硬盘读写

并行计算的挑战

  • 编程困难
    • 并行性识别与表达,难写
    • 同步语句,难写对
  • 性能调优难,难写快 (并行计算目标就是提升性能,性能调优难)
    -负载平衡
    • 局部性 (高速缓存cache,使用cache可以快10倍左右)
  • 容错难

并行计算中的局部性

矩阵相乘,按列访问会造成cache失效


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分块算法,得到更高的局部性

高可用性

大数据处理系统通常是由大量不可靠服务器组成的,如果处理1个10天的大数据处理任务时在第8天机器坏掉怎么办?
重新计算不一定能解决问题
传统的容错方法不适用

  • 锁步法(性能会有较大影响),多版本编程(多个人来编程,对比结果,软件容错)
    检查点设置与恢复(保存程序状态,从保存状态位置继续执行,IO量大)

大数据处理并行系统

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内存计算需求

Map Reduce成功之处

  • 用户只需要编写串行程序
  • 自动并行化和分布式执行
  • 自动容错
  • 自动负载平衡
    用户对系统提出了更高的要求
  • 更复杂的多阶段任务
  • 交互式查询
    Map Reduce 的局限性
  • 表达能力有限
    • 只有Map 和Reduce两种操作
  • 复杂任务通常需要迭代的 MapReduce
    • 需要将中间结构保存在硬盘上
    • 大量I/O操作造成性能急剧下降
  • 引入的I/O操作多,只能做离线分析,很难支持数据的交互式查询

MapReduce 文件传递数据

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如果能用内存保存数据?

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比采用硬盘方案快10-100倍
In Memory Computing

内存计算的可行性

问题:

  • 内存是否足够大能够装下所需要的数据?
  • 内存有多贵?与硬盘相比性价比如何?
  • 数据保存在硬盘上,可以保证数据的可用性,放在内存里如何容错?
  • 如何高效表示内存里的数据?
    input -> iter1 -> memory -> iter2 -> memory
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单位芯片上集成的晶体管数量随着时间(每两年)可以成倍增长

各个内存层次的延迟

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DRAM比硬盘快100,000倍,但是DRAM比片上cache慢6-200倍

内存计算的实例:SPARK

SPARK设计理念:着重效率和容错
如何抽象多台机器的内存?

  • 分布式共享内存(DSM)
    • 统一地址空间
    • 很难容错
  • 分布式键-值存储(Piccolo,RAMCloud)
    • 允许细粒度访问
    • 可以修改数据(mutable)
    • 容错开销大

DSM和键值对的容错机制

  • 副本或Log
    • 对数据密集应用来说开销很大
    • 比内存写要慢10-100倍

解决方案

  • RDD(Resilient Distributed Datasets)
    • 基于数据集合,而不是单个数据
    • 由确定性的粗粒度操作产生(map,filter,join等)
    • 数据一旦产生,就不能修改(immutable)
    • 如果要修改数据,要通过数据集的变换来产生新的数据集

高效容错方法

  • 数据一旦是确定性的产生,并且产生后不会变化
    • 就可以通过“重复计算”的方法恢复数据
    • 只要记住rdd生成过程就可以了,这样一次log可以用于很多数据,在不出错的时候几乎没有开销


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大数据处理并行系统

用编程模型上的限制获取好的容错能力和高性能


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K-V 对,细粒度修改; HDFS 只能添加数据
RDD 高吞吐率,不允许做细粒度修改,换取好的容错能力和好的性能

SPARK 编程接口

  • 基于Scala 语言
    • 类似Java的一种函数语言
    • 可以在Scala控制台上交互式地使用Spark
    • 现在也支持Java 和Python
  • 基于RDD的操作
    • Transformation: 从现有RDD产生新的RDD
      • map, reduce, filter, groupBy, sort, distinct, sample ...
    • Action: 从RDD返回一个值
    • count, collect, first ,foreach ...


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SPARK 编程实例--LOG挖掘
将数据从文件系统中调入内存,然后进行交互式的查询


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lines = spark.textFile("hdfs://...")
errors = lines.filter(_.startsWith("ERROR"))
messages = errors.map(_.split('\t')(2))
cachedMsgs = messages.cache()
cachedMsgs.filter(_.contains("foo")).count // 包含foo的信息的数目
cachedMsgs.filter(_.contains("bar")).count
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SPARK 实现技术

延迟估值(Lazy Evaluation)

val lines = sc.textFile("data.txt")  //transformation
val lineLengths = lines.map(s => s.length) //transformation
val totalLength = lineLengths.reduce((a,b) => a+b) //action, trigger computation
  • 前面两行都不会触发计算(Transformation)
  • 最后一行的reduce会引发计算,生成DAG
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有向无环图


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RDD性能的提高

对需要重用的RDD使用Persist和Cache提高性能


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SPARK 应用和生态环境

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SPARK 局限性

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只能复制一份,标记少数节点。操作为网络操作、内存拷贝操作、IO操作(由于数据是只读的)-> 效率低,大量内存拷贝。
每次细粒度的数据更新,由于spark基于粗粒度RDD只读的数据对象模型,需要RDD变换,即有大量数据的复制,导致处理效率不高

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