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cellranger使用的初步探索（4）：R读取cellranger的输出文件在上一篇笔记里，练习了使用cellranger aggr整合不同GEM well的样品（cellranger使用的初步探索（3）cellrang...
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cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr在学习cellranger aggr这一步之前，还是需要再一次复习10x Genomics的测序原理。在cellranger aggr部分，官网...
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cellranger使用的初步探索（2）理解cellranger count输出文件在上一篇笔记的结尾处，提到了cellranger count这一步，之前几天我一直是用的服务器里128G和200G的内存试着运行这一步，并且限制...
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cellranger使用的初步探索（1）本篇笔记是按照单细胞天地公众号教程里的代码练习的，因为之前了解到cell ranger运行需要大量的内存，无奈自己的电脑配置不行，现在有了服务器...
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RNA velocity分析练习（四）聚类以及velocity可视化系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软件安装3.RNA veloci...
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RNA velocity分析练习（三）生成loom文件
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软件安装 Velocyto软件针...
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RNA velocity分析练习（二）软件安装
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理 要获取我们需要的loom文件，你需要先安装以下文件： 首先要求你的pyt...
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RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理目前有多种方法可以进行RNA velocity的分析： scVelo（参考文章：单细胞转录组数据分析|| scVelo 教程：RNA速率分析工具...
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RNA velocity of single cells文献学习在之前的一个视频学习系列笔记里，有一篇笔记提到了RNA velocity（Single cell RNA-seq data analysis w...
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