写在前面 硕士毕业做的大豆内参基因的筛选,当时用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三个软件,geNorm 不需要多说,...
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[toc] 之前我们微生物生态网络基于igraph进行出图,这是基础包写的出图函数,近年来,随着ggplot的普及,使用ggplot出图似乎成了...
autoprokka.py这个Python脚本可以方便地批量地使用prokka去进行注释,自动按照输入文件名去命名输出文件,并且每个样本单独一个...
00 写在前面 测序后公司交付数据时,一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理,记得一定要...
tags: RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq 产出的数据进行变异检测分析,与...
deepTools 是一套基于python开发的工具,适用于有效处理分析高通量测序数据,可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase...
本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包,先生成随机数据: data1如下: 查看数据范围: ...
基因表达 什么是基因表达,如下是来自于维基百科的解释: 研究方法 定量PCR 这部分我不太懂,所以就放几段百度百科和维基百科的定义。 百度百科 ...
最近跑通了一遍GWAS分析,全程在linux操作,虽然具体还有好多需要微调的地方,先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈...
(已合并粒子群算法(1)(2)(3)于此) 1. 粒子群算法简介 粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO)是...
专题公告
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