如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树，可以展示群体中不同个体的相互关系，基因变异相似的往往会在同一个树的cluster中，一颗好的树可...
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如何构建SNPs-based phylogenetic tree
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R中数据可视化的n种形式今天给大家推荐一个网站，该网站为我们提供了数据可视化的多种形式。 网站的名字叫做r-graph-gallery，具体的网址：https://ww...
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使用R语言绘制热图：R包pheatmap的全参数详细介绍pheatmap参数： 网上有针对热图绘制的粗略讲解，但是都是参数不完整，可能不能满足所有人需求，于是手动整理了热图的全参数介绍。 mat 数组...
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RNA-seq: Kallisto+Sleuth(1)本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速度非常快，在我的Mac Pro...
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生物信息数据库的使用superqun 原创于简书 手工目录： Q1:如何在肺癌数据库中选出k-ras突变的病人样本。 1. 使用GDC下载。 在GDC portal...
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RNA-seq:Kallisto+Sleuth (2)Kallisto下游推荐的分析软件是Sleuth，所以我们本次介绍如何使用Sleuth进行相关的分析。 RNA-seq在完成转录本的鉴定及定量后...
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The Connectivity Map-揭示化合物，基因和疾病状态的功能联系The Connectivity Map, or CMap, is a resource that uses cellular response...
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Adonis与ANOSIM检验究竟是什么？做微生物16S测序的时候，公司的报告里经常会给到两种检验Adonis和ANOSIM，听过t.test、wilicox、anova各种检验，那么A...
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GOplot 可视化基因富集分析结果GOplot 包通过封装好的函数可视化基因功能分析结果。 #1. 安装 #2. GOplot 内置数据 ##2.1 脑和心脏内皮细胞的转录组数据...
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提取半数以上样本中CPM大于2的基因
CPM<-read.table("~/Desktop/OneDrive/GTEx/cpm.tsv",header = T,row.names =...
专题公告
高通量数据的处理，生物大数据分析，基因组，转录组，表观遗传。
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