Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajim...
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Tajima's D 中性检测的指标
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GWAS基本建模原理混合线性模型 我们说的混合线性模型主要是由固定效应和随机效应所构成的，固定效应是我们主要研究的影响因素，而随机效应是潜在的，影响固定效应的因素。...
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用R语言做GWAS分析该流程有：GWAS的QC，PCA分析，Manhattan图，QQ图，候选位点的功能分析 参考学习资料：Genome-wide associati...
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简化基因组群体分析1.stack寻找位点1)数据预处理数据下机经过拆分去接头获得原始数据 由于拆分数据用的引物街头长度不一，获得的原始数据的长度也有差异，这对后续...
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gwas分析时数据格式转换
排序 从vcf文件排序开始，可以使用picard，也可以使用vcftools 的vcf-sort vcf转换为ped和map文件 将vcf文件转...
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haploPS、XP-EHH、 Fst检测正向选择信号的实例介绍
欢迎来到"bio生物信息"的世界 下面是一篇文献介绍。 关于人类基因组正向选择信号的检测分析。 1.正向选择的概念 正向选择：某一突变位点逐渐积...
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「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析谈论到直系同源基因分析的时候，大部分教程都是介绍OrthoMCL，这是2003年发表的一个工具，目前的引用次数已经达到了3000多，但这个软件似...
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群体遗传 || 选择压力分析_基础知识个人博客原文地址 基本原理 [站外图片上传中...(image-38780a-1577372733833)]原始群体中，遗传多样性是十分高的，整...
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#阅后即焚#遗传图谱基础原理培训资料基本概念 图谱应用 构建流程 QTL定位 Q&A
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跑通GWAS，用这些脚本就够了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈...
专题公告
前人栽树后人乘凉
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