PySpark如何设置worker的python命令

前言

因为最近在研究spark-deep-learning项目,所以重点补习了下之前PySpark相关的知识,跟着源码走了一遍。希望能够对本文的读者有所帮助。

问题描述

关于PySpark的基本机制我就不讲太多,你google搜索“PySpark原理”就会有不少还不错的文章。我这次是遇到一个问题,因为我原先安装了python2.7, python3.6。 后面为了方便我在我的电脑上使用virtualenv来做环境隔离,这个时候就发生一个比较诡异的事情:

在driver端能够正常使用PIL图片处理模块,但是executor端则不行。那显然是我在~/.bash_profile的配置 在executor 启动python worker时没有生效,程序依然走了我早先安装的 python2.7,而早先的2.7里我没有安装PIL。那么应该怎么解决这个问题呢?

Python里的RDD 和 JVM的RDD如何进行关联

要解答上面的问题,核心是要判定JVM里的PythonRunner启动python worker时,python的地址是怎么指定的。

我们以python rdd里的map作为起点,

def map(self, f, preservesPartitioning=False):       
        def func(_, iterator):
            return map(f, iterator)
        return self.mapPartitionsWithIndex(func, preservesPartitioning)

进入self.mapPartitionsWithIndex:

  def mapPartitionsWithIndex(self, f, preservesPartitioning=False):
      
        return PipelinedRDD(self, f, preservesPartitioning)

可以看到PipelinedRDD,进入PipelinedRDD._jrdd里,可以看到:

       wrapped_func = _wrap_function(self.ctx, self.func, self._prev_jrdd_deserializer,
                                      self._jrdd_deserializer, profiler)
        python_rdd = self.ctx._jvm.PythonRDD(self._prev_jrdd.rdd(), wrapped_func,
                                             self.preservesPartitioning)
        self._jrdd_val = python_rdd.asJavaRDD()

这里和JVM里的PythonRDD建立了联系。进入_wrap_function:

pickled_command, broadcast_vars, env, includes = _prepare_for_python_RDD(sc, command)
    return sc._jvm.PythonFunction(bytearray(pickled_command), env, includes, sc.pythonExec, sc.pythonVer, broadcast_vars, sc._javaAccumulator)

我们看到了sc.pythonExec对象,这个是传入到PythonRDD里的python命令。为了看的更清楚,我们看看sc.pythonExec的申明:

self.pythonExec = os.environ.get("PYSPARK_PYTHON", 'python')

也就是你在很多文档中看到的,通过设置PYSPARK_PYTHON变量来设置启用哪个python。那么pythonExec是JVM里是怎么用的呢?

private[spark] class PythonRDD(
    parent: RDD[_],
    func: PythonFunction,
    preservePartitoning: Boolean)
  extends RDD[Array[Byte]](parent) {

PythonRDD是在python中通过_jvm对象在JVM里创建的,里面哟给重要的对象是PythonFunction,这个PythonFunction就是wrapped_func,wrapped_func里包含了env,pythonExec等。PythonRDD的compute方法里会调用PythonRunner的compute方法:

val runner = PythonRunner(func, bufferSize, reuse_worker)
    runner.compute(firstParent.iterator(split, context), split.index, context)

上面的func其实就是PythonFunction,在PythonRunner里你可以看到:

 // All the Python functions should have the same exec, version and envvars.
  private val envVars = funcs.head.funcs.head.envVars
  private val pythonExec = funcs.head.funcs.head.pythonExec
  private val pythonVer = funcs.head.funcs.head.pythonVer

三个变量的申明,具体使用在这:

val worker: Socket = env.createPythonWorker(pythonExec, envVars.asScala.toMap)

这里通过pythonRunner运行启动python worker。

额外福利:Python如何启动JVM,从而启动Spark

建议配置一套spark的开发环境,然后debug进行跟踪。Python启动时,首先启动SparkContext(context.py),在init 方法里会_ensure_initialized 方法确保Java 里的SparkContext被初始化:

@classmethod
    def _ensure_initialized(cls, instance=None, gateway=None, conf=None):
        with SparkContext._lock:
            if not SparkContext._gateway:
                SparkContext._gateway = gateway or launch_gateway(conf)
                SparkContext._jvm = SparkContext._gateway.jvm

初始时会调用lauch_gateway(java_gateway.py),该方法首先会到环境变量里找SPARK_HOME,然后使用里面的./bin/spark-submit 进行Spark的启动,通过环境变量中的PYSPARK_SUBMIT_ARGS获取一些参数,默认是pyspark-shell,最后通过Popen 启动Spark进程,返回一个JavaGateWay,之后持有这个对象,就可以向JVM发送指令了。

解决问题

有了上面的铺垫后,问题就变得很好解决了,下面的单元测试原先是跑步过去的

def test_readImages(self):
        # Test that reading
        imageDF = imageIO._readImages("some/path", 2, self.binaryFilesMock)
        self.assertTrue("image" in imageDF.schema.names)
        self.assertTrue("filePath" in imageDF.schema.names)

        # The DF should have 2 images and 1 null.
        self.assertEqual(imageDF.count(), 3)
        validImages = imageDF.filter(col("image").isNotNull())
        self.assertEqual(validImages.count(), 2)

        img = validImages.first().image
        self.assertEqual(img.height, array.shape[0])
        self.assertEqual(img.width, array.shape[1])
        self.assertEqual(imageIO.imageType(img).nChannels, array.shape[2])
        self.assertEqual(img.data, array.tobytes())

现在我该如何让他通过呢?可以在setUp的时候添加

import os
os.environ["PYSPARK_PYTHON"] = "your-python-path" 

即可。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 156,265评论 4 359
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 66,274评论 1 288
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 106,087评论 0 237
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 43,479评论 0 203
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 51,782评论 3 285
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 40,218评论 1 207
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 31,594评论 2 309
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 30,316评论 0 194
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 33,955评论 1 237
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 30,274评论 2 240
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 31,803评论 1 255
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 28,177评论 2 250
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 32,732评论 3 229
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 25,953评论 0 8
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 26,687评论 0 192
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 35,263评论 2 267
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 35,189评论 2 258

推荐阅读更多精彩内容